15 au 19 juin 2015
L’objectif fondamental de la conférence est de se faire l’écho des avancées méthodologiques et conceptuelles actuelles dans l’étude des processus stochastiques utilisés dans la modélisation en écologie, en génétique des populations et en évolution. L’objectif est de stimuler le développement de modèles stochastiques de pointe qui permettront une meilleure compréhension des processus d’évolution à diverses échelles, des gènes aux populations, communautés et écosystèmes. Les principaux problèmes mathématiques qui seront abordés peuvent être décrits par les thèmes suivants (et les interactions entre ceux-ci) :
– Comportement à grande échelle et événements rares dans la dynamique des populations – Arbres, coalescents et processus historiques – Processus de branchement généralisés – Modèles spatiaux en écologie et en génétique des populations – Réseaux aléatoires en épidémiologie La conférence abordera l’étude de plusieurs phénomènes biologiques importants dans des domaines tels que l’épidémiologie, l’écologie, la génétique des populations et la phylogénie, en particulier les phénomènes à large échelle tels que les colonisations à longue portée, la macro-évolution de traits de vie, les arbres d’espèces, et les épidémies de maladies émergentes. L’étude de ces phénomènes soulève un bon nombre de questions profondes qui impliquent des structures mathématiques complexes et exigent l’introduction de nouveaux modèles et de nouvelles techniques de la théorie des probabilités. Un objectif essentiel de la conférence est donc de mettre en lumière l’étude d’outils mathématiques avancés, tout en gardant à l’esprit la réalité biologique et les applications potentielles dans les sciences de la vie. Les interactions de la génétique et de l’écologie sont de première importance et méritent toujours plus d’attention aux échelles de la génétique des populations. La dépendance de la fitness individuelle par rapport à l’état de la population entière, et les interactions avec les conditions environnementales locales et globales sont des ingrédients essentiels de la modélisation. D’autres thèmes qui seront abordés dans la conférence, et qui font partie de la thématique de l’évolution biologique en un sens élargi, incluent les modèles de croissance des tumeurs, les modèles probabilistes de l’épidémiologie basés sur les outils de la dynamique des populations et des graphes aléatoires, ainsi que la génétique des populations de virus. |
Comité scientifique
Matthias Birkner (Johannes-Gutenberg-Universität) Comité d’organisation Etienne Pardoux (Aix-Marseille Université) Conférenciers
Multitype branching processes: from bacteria to cancer
Ancestral selection graph meets lookdown construction
Coming down from infinity for some population models
Extending the infinitesimal model
The site frequency spectrum of dispensable gene sequences
Branching processes with competition by pruning of Levy trees
Random walks in dynamic random environments and ancestry under local population regulation
Genetic variability under the seed bank coalescent
Limits in adaptive dynamics
Existence of open evolutionary paths in a rugged landscape
The limit of small mutations in a stochastic individual-based model and the canonical equation of adaptive dynamics
A stochastic individual-based model for immunotherapy of cancer
Genetic diversity in the interference selection limit
Recovering a tree from randomly sampled phylogenetic diversities
An individual-based model for Lenski’s long-term evolution experiment
New evolutionary models for the long range dependencies of loosely linked loci
Directed evolution of phage lysins: using mathematical models to explore feasibility/design of new antibacterial drugs
Adaptive walks on correlated fitness landscapes
Phylodynamic analysis of rapidly evolving pathogens
Do it yourself lookdown constructions: It is safe to build them at home
Adaptive evolution of molecular quantitative traits
A non exchangeable coalescent arising in phylogenetics
Competitive populations with vertical and horizontal transmissions
Quantifying and predicting the evolution of RNA viruses
Escaping from the Boundary in Density Dependent Population Processes.
The hydrodynamic limit for beta coalescents that come down from infinity
Genealogy of a branching process with overlapping generations
Plant ecology influences population genetics: the role of seed banks in structuring genetic diversity
Genealogies with recombination in spatial population genetics
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